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1、对每一个条件进行转录组测序,全面评价细胞对不同处理条件的响应;

2、操作简便、快速,可在72小时内同时完成数百个处理条件的建库;

3、价格低廉,每个处理条件的RNA-seq价格是传统RNA-seq的1/5;

4、准确,与传统RNA-seq和qPCR相当的可比性;

5、应用广泛,可用于人和小鼠的细胞筛选,不同的处理既可以是药物筛选,也可以是基于RNAi,CRISPR-Cas9以及cDNA的筛选。

    基于细胞表型的高通量筛选是药物研发和很多原创生物学发现的基石。传统的高通量筛选大多基于单一的细胞表型,比如增殖,形态或细胞类型特异的某一生物标记物。在这一过程中,细胞状态或基因表达的细微变化,通常被忽略,而前者往往可以为药物作用机制和脱靶效应的深入研究提供重要的线索。此外,传统的基于单一细胞表型的高通量筛选技术不能用来检验在设计实验时可能没有考虑到的假设,导致在一次筛选过程中可能遗漏掉很多未知的发现。因此,人们越来越有兴趣将高通量筛选与基于全组学的报告体系(genome-wide reporters)结合起来,这将为筛选提供更全面的读出指标。然而,大多数标准的基于全组学(比如RNA-seq)的实验方案都需要繁琐的操作,操作少数样本尚可,但对于同时处理成千上万的样本则过于繁琐。并且该方法对于高通量实验来说成本高昂。为了解决上述局限,昕瑞再生联合北京大学分子医学研究所细胞重编程与再生医疗研究室合作,开发出一种操作简便、快速、价格低廉的高度集成化的基于全转录组测序的高通量筛选方案——Plastech-seq。

方案来源

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